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144 | 專訪台大教授陳倩瑜：用人工智慧建立台灣基因資料庫
文／蕭紫菡（特約撰稿人） （原文發佈於2022年4月29日）
2009年，台灣魔圍棋程式MoGoTW與職業九段的棋王周俊勳，以三局九路對弈當中，棋王飲恨一局。而在2016年，被英國人工智慧公司DeepMind 開發的程式AIphaGo AI打敗的南韓圍棋棋王李世乭，在接受媒體訪問時說，因見識到無法被擊敗的AI，促使他有了退休念頭。
陳倩瑜在AI這條路上，則是越走越深。國立台灣大學生物機電工程學系教授陳倩瑜，也是台灣AI Labs的基因團隊夥伴。近二十年來，致力鑽研以AI了解生命科學，透過有效的資料分析，產出對未來的醫療及農業都有所幫助的研究結果。
「人類未來可以根據自己的基因，選擇預防或聽天由命。」
「過去二十年，生物資訊的資料量已累積得相當驚人，已不是一個人用眼睛看，或單純用Excel整理就能完成分析。」陳倩瑜說。
生物技術在近年有突破性的發展，生物學家不再像以前一樣，一輩子只研究一種蛋白質或一種基因，現在的技術，已可同時看到上萬個基因或其於個體中的各種變化，包括隨著身體機能的成長衰退，分子如何產生不同的行為。
「因此，透過資訊技術的幫忙，通過資料分析，把資料變成有意義的資訊，再變成知識。整個抽絲剝繭的過程就需要AI的技術，當資料轉為有用知識後，對整個醫療、農業、產業、經濟，都會帶來大幅影響。」
例如，存在於生物體中的蛋白質，本來很不容易觀察到，除非做一些耗時的實驗，去年開始，AI突破性地做到了，所有蛋白質結構都可以用電腦算出來，甚至整個生命科學都受到動搖。
陳倩瑜說，研究最後都會來到一個關鍵點，DNA的改變如何影響個體行為？不限物種，某些方法一旦做到，它不是只有對人類有幫助，對細菌、病毒的所有蛋白質結構預測都可獲得。
例如，人類的DNA受損時，會產生疾病，在研究上，就會透過AI演算觀察DNA分子發生突變時，生物系統如何運作？問題是如何發生的？如何預防治療？發生時有沒有什麼方法挽救？例如，為什麼有些昆蟲攝入農藥會死，有些不會？為什麼有些疫苗對某些人有效，某些人無效？為什麼有些生長於高海拔的動物有某些身體特徵？這些問題，透過AI分析DNA的資料，都有機會獲得解答。
「我們的研究，若能對疾病風險有更深入的了解，就能幫助人們選擇預防，或者選擇聽天由命。現在已經來到一個時間點，人類未來可以根據自己的基因，事先知道吃這藥對自己有效或無效，就能選擇。」
「永遠不要放棄尋找什麼是適合你的，就像尋找伴侶一樣。」
繁雜的研究過程相當耗時，且每個專案通常都會遇到困難，若不是由衷熱愛，恐怕很難一走二十年。
「其實，我從小是學音樂的。」陳倩瑜笑說，雖然在表演上沒有表現得很好，但在充滿邏輯的「樂理」上卻覺得充滿趣味。而一方面因為手不夠大，在樂器的學習路上感到挫折；另一方面，國中後，她在數理上的表現開始比一般人好，國二後，她就轉到普通班，一路參加比賽、考試，保送台中女中。
考大學時，很多同學要考醫科，但，當時的她，覺得生物是個要「背」的科目，她喜歡的還是具邏輯思考性的數理。因此，後來選擇了台大電機工程學系。
畢業後，出國攻讀史丹佛大學電機工程學研究所，回國後的她，一直以為，自己的未來就是當工程師。回國後，她先在硬體IC設計廠服務，沒想到，這份工作成了她人生的重要轉折。
「我發現自己無法每天到一個固定的地方，重複做類似的事，卻不再常有新東西學習。那時我才發現我很喜歡學新東西，把消化完的資訊跟大家分享，透過分享我能從回饋中得到快樂。求學過程當助教時我似乎就有這特質，只是當時我並不知道。」
工作一年後，她決定辭職，回到校園繼續進修，當時，她觀察到未來社會對軟體工程師有大量需求，上百萬的電晶體設計不只是靠聰明的腦袋，還加上很好的軟體，因此，她後來選擇攻讀台大資工博士班，結合軟體與資料分析，從此踏上資料科學的道路。
在攻讀博士的過程中，她接觸了分子生物學這門知識，發現透過量測、進入系統、再把模型建立後做預測的過程⋯⋯原以為靠死背的生物對她而言變得很有趣，並且把數理一起整合了進來，兩件事搭在一起，成了她想探索的新領域。
「我感覺自己真正的學習是從那時開始——更明確去追尋自己想要的，從被動轉為主動學習。並非每個人都要從職場回到學校念書，但我鼓勵每個同學，應意識到你的學習不會在某個階段就結束，人生要學習的還非常多，找工作也不需要一次到位，永遠不要放棄尋找什麼是適合你、你也喜歡的工作，就像尋找伴侶一樣。而這一切不會從天上掉下來，一定要嘗試才知道。」
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