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作者:Lawrence Lee(来自豆瓣)

来源:https://www.douban.com/note/750498535/


这一篇比较简短,只是单纯根据目前掌握的科学证据给几个可能的结论:


1. 现在各地采集的病毒基因数据还是太少,我们无法通过现在有限的样本推测病毒进化与变异(evolution and mutation)的速率、趋势及可能的诱因。但是从现在公开的24个病毒样本来看,差异非常少,最多只经过三处变异,有些则完全相同。因此中间宿主可以基本排除,可能性最大的假设是【最早的感染者是被原始病原体直接感染的,而原始病原体的序列与结构和如今采集的样本也几乎无差异】。


2. 除了SARS冠状病毒以外,新型冠状病毒的核衣壳蛋白不与其他任何已知会感染人的冠状病毒产生交叉反应(cross-reactive)。对7位患者样本的血清测试显示其中5位在被病毒感染20天后产生了IgG抗体,因此患者的血清可以在Vero E6细胞内中和新型冠状病毒。新型冠状病毒也可被SARS冠状病毒免疫血清的稀释液中和。这说明新型冠状病毒的纤突蛋白结构及感染时人体内的受体与SARS冠状病毒极度相似。然而新型冠状病毒的复制酶基因(replicase genes)与SARS冠状病毒差异却在10%以上,并且新型冠状病毒的纤突蛋白与SARS冠状病毒所有毒株的纤突蛋白同源性(homologous)在75%以下。这些数据表明新型冠状病毒并非SARS冠状病毒同类病毒的变异结果。然而两种冠状病毒都可通过进入HeLa细胞结合ACE2受体,纤突蛋白的折叠构型又极度相似,因此【存在新型冠状病毒是参照SARS冠状病毒感染人体的特性人为制造出来的可能】。


3. 武汉病毒所公布一种叫做BatCoV RaTG13的冠状病毒与新型冠状病毒具有96.7%的序列相似性。一种病毒发现近7年后,序列还能保持如此相似度是不正常的。这种病毒【暴露在自然条件下近7年后发生了获得感染人能力的变异的可能性】,远低于【这种病毒在实验室环境中被保存近7年,近日才变异并释出的可能性】。另武汉病毒所在发现近七年内不对外公布BatCoV RaTG13的相关资料,特别是不公布相应蛋白序列与模型的选择,令人费解。目前似乎还无法在主流资料库中找到有关这个病毒的详细信息,有朋友找到了烦请告知我。


参考资料:


1. Masters PS. Coronavirus genomic RNA packaging. Virology 2019;537:198-207. doi:10.1016/j.virol.2019.08.031


2. Lo C-Y, Tsai T-L, Lin C-N, Lin C-H, Wu H-Y. Interaction of coronavirus nucleocapsid protein with the 5’- and 3’-ends of the coronavirus genome is involved in genome circularization and negative-strand RNA synthesis. FEBS J 2019;286(16):3222-3239. doi:10.1111/febs.14863


3. Zhou P, Yang X-L, Wang X-G, et al. Discovery of a novel coronavirus associated with the recent pneumonia outbreak in humans and its potential bat origin. bioRxiv January 23, 2020. doi:10.1101/2020.01.22.914952


4. Zhu N, Zhang D, Wang W, et al. A novel coronavirus from patients with pneumonia in China, 2019. N Engl J Med 2020. Epub ahead of print. doi:10.1056/NEJMoa2001017


5. Robertson DI. nCoV’s relationship to bat coronaviruses & recombination signals (no snakes). January 22, 2020. http:// virological.org/t/ncovs-relationship-to-bat-coronavirusesrecombination-signals-no-snakes/331. Accessed January 24, 2020.


6. Benvenuto D, Giovanetti M, Ciccozzi A, Spoto S, Angeletti S, Ciccozzi M. The 2019-new coronavirus epidemic: evidence for virus evolution. bioRxiv January 24, 2020. doi:https://doi. org/10.1101/2020.01.24.915157


7. Bedford T, Richard N, Hadfield J, Hodcroft E, Ilcisin M, Muller N. Narrative: genomic analysis of nCoV spread. Situation report 2020-01-23. nextstrain January 23, 2020. https://nextstrain.org/ narratives/ncov/sit-rep/2020-01-23?n=1. Accessed January 24, 2020.


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