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美國的SARS-CoV-2變種隱憂

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先來一個摘要:暫時SARS-CoV-2的變異方向是以加速感染為主而不在於致死率,但要知道重症患者血液內的病毒量相對高,假若病毒在體內複製率在未來的日子加速,重症患者出現的數量便會增加,而這樣亦會減弱了疫苗的效用。所以,除了要看抗體對變異S蛋白是否有效外,抗體的製造量也會直接影響患者的病情。

這是一場生死時速的競賽,究竟是疫苗戰勝?還是病毒永續?

病毒變種雖然不是什麼新鮮的事,但在COVID-19還未消退的日子下,一方面擔心著變種會否令病毒傳播率提高,另一方面則擔心疫苗是否能有效對付變種病毒。

從2020年3月在歐洲地區起源的D614G變種開始,病毒的傳播率越來越快,但病毒並沒有因為D614G而停下來,畢竟,大自然的演化之力是不會停下來的。然後,就是英國在 9月時出現的N501Y變種(B1.1.7, 20I/501Y.V1),這個變異同樣也在南非(B.1.351, 20H/501Y.V2)及巴西(P.1, 20J/501Y.V3及P.2)找到。而在南非及巴西還有K417N/T及E484K。

  • N501Y – 提升SARS-CoV-2 感染力或傳染能力,香港於 17/2 總計有 35 宗輸入病例有N501Y變種。
  • K417N/T及E484K – 可能會令病毒能避開抗體的攻擊(Antibody neutralization)

而佔全球 1/3 案例的美國,確診數量達到2千8百萬人,差不多每10 名美國人中便有一名是確診者,而變種的情況及方向跟歐洲截然不同。在這個地球成為一個地球村前,各大陸之間的往來稀疏,在數萬年前的地球,那時每一個大陸就像一個個異地星球一般互不干涉,物種在各大陸各自演化成多姿多彩的生物圈。直到人類這個既霸道且破壞力驚人的物種把各大陸連繫,把生物多樣性大幅減少後,地球便變得平平無奇了。

在美國分別有以下在S蛋白找到的變異:

D614G - 此變異改變了S蛋白的結構並更容易跟ACE-2受體結合,因為D614G會增加S蛋白的「耐用度」,增加了S蛋白跟ACE-2受體結合的機會。
S477N / N439K - 這兩個變異在澳洲及歐也曾出現,它們會降低抗體的效能,以及增加病毒跟ACE-2受體的相互吸引力。
Q677H / Q677P - 於2020年尾於Louisiana 及新墨西哥發現,這變種出現了 7 個分支,6 個是Q667H相關,餘下一個是Q667P分支。Q667的位置跟另一個變異P681R接近(烏干達出現,英國也有的),也是位處於polybasic site,這個區域會增強病毒在培養皿內複製的速度,也會影響病況的進展。但Q667的影響還要進行更多的研究才能確定。

在眾多於S蛋白的變異中,最令人擔心的分別是D614G / N501Y / E484K / Q667,可幸的是還未有一個新的變種集齊這 4 個變異。但疫苗是一個很強的演化推力,病毒會走向那一個方向?沒有人知道。

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